Hnutí Stačilo! svým programem namířeným proti církvi rozezlilo nejen politické konkurenty z KDU-ČSL, ale také nejvyšší vedení katolické církve, včetně arcibiskupa Jana Graubnera. Ten se domnívá, že vědomá podpora zla je hřích, proto i volba hnutí Stačilo! je hříchem. Šéf lidovců Marek Výborný pro Echo24 řekl, že komunista komunistou zůstane, i když upraví program. Uvedl to v reakci na úpravu části programu Stačilo! spojeného s rušením církevních sňatků.

Deník Echo24 již informoval o tom, že hnutí Stačilo! v programu požaduje vyčlenění problematiky církví a náboženských společností z agendy ministerstva kultury a vytvoření nezávislého kontrolního orgánu, který by dohlížel na činnost církví a náboženských společností, včetně dodržování zákonů, transparentnosti financování a nakládání s majetkem. Chce také zamezit „vzniku účelových společností, respektive zvýšit minimální počet členů pro registraci náboženské společnosti z 300 na 1000 osob“ a zároveň chce požadovat prodloužení minimální doby činnosti před přiznáním oprávnění k výkonu zvláštních práv z 10 na 20 let.

Dále chce hnutí dokončit odluku církve od státu, včetně financování, zavést mechanismy, které by umožnily státu kontrolovat, zda církve a náboženské společnosti využívají majetek získaný v rámci majetkového vyrovnání v souladu s jeho účelem. Zpřísnit chce také tresty za zneužívání náboženské svobody k páchání trestné činnosti (např. podvody, násilí, extremismus). Zvláštní přitěžující okolnost, že byl trestný čin spáchán z náboženské pohnutky. V neposlední řadě chce Stačilo! snížit podporu církevním školám.

V části programu Kultura se ještě dopoledne psalo o změnách v církevních sňatcích. „Zrušení církevních sňatků s nepodmíněným plným efektem v rámci světského práva v rámci občanského zákoníku. Církevní sňatek by měl být vystavěn toliko jako symbolický s jeho povinnou legalizací na civilním úřadu,“ psalo Stačilo! v programu. Tato část nicméně z programu zmizela. Mluvčí Stačilo! Roman Roun to redakci vysvětlil s tím, že hnutí chystá novou textaci, respektive dovysvětlení své priority, neboť mu vadí, že KDU-ČSL původní znění „překroutilo a zneužilo pro svou kampaň“. Ani po týdnu se církevní sňatky v programu Stačilo! neobjevily.

Pro server Aktuálně.cz se ostře vyjádřil také arcibiskup Jan Graubner „Někteří křesťané jsou schopní dát hlas Stačilo! (tedy komunistům). Ti přitom už ve volebním programu slibují výrazné kroky proti věřícím, ale i ostatním lidem. Vědomá podpora zla je hřích,“ varoval Graubner. „Nemohu dát hlas stranám, které šíří nenávist vůči jakýmkoliv skupinám lidí (Ukrajinci, Židé, lidé s odlišnou orientací…),“ uvedl Graubner s tím, že nebude volit nikoho, kdo by chtěl vystupovat z NATO a EU, což je jak Stačilo!, tak SPD.

Graubner zároveň ve vyjádření pro Aktuálně připojil prosbu, aby lidé k volbám přišli, hříchem je totiž podle něj i „hloupost zaviněná nezájmem“. „Není to jenom moje právo, ale i výraz odpovědnosti za sebe, rodinu, přátele i za stát,“ řekl arcibiskup a varoval, aby se lidé vyhnuli nejen některým politickým uskupením, ale i některým konkrétním kandidátům. „Pokud dám hlas lidem morálně zkaženým, kteří šíří nenávist a zlo, mám osobní odpovědnost za následky takové volby. Sám mám díl odpovědnosti za zlo, které způsobí,“ uvedl Graubner.